Mitya
Почетный форумчанин
- Сообщения
- 3.378
- Лайки
- 1.485
- Баллы
- 128
...
Состав протеома человека и метаболома отражают микробиом и активность
Поскольку многие из белков и метаболитов в человеческом голобионте имеют микробное происхождение, состав протеома ME / CFS и метаболом изменяются в зависимости от видового состава
микробиома. Протеомный и метаболомный анализы дополнительно отражают активность микробиома. Это связано с тем, что микробы и вирусы часто изменяют свою экспрессию генов так, что со временем они экспрессируют различные белки и метаболиты. Геном человека и связанные с ним эпигенетические изменения также вносят вклад в метаболическое разнообразие, хотя высокий уровень избыточности между человеческими и микробными метаболитами может затруднить выявление происхождения этих ассоциаций.
Schutzer et al. ( 94 ) показал , что цереброспинальный протеом ME / CFS существенно отличается от здорового (рис (Figure2).2 ). Действительно, 738 из 2783 идентифицированных белков (26,5%) были уникальными для пациентов с ME / CFS, предоставляя убедительные доказательства того, что ME / CFS действительно характеризуется дисбиозом микробиома в ткани и крови. Также было показано, что состав метаболома крови изменяется в ME / CFS. В одном из таких исследований сообщалось о повышенном уровне холина, карнитина и сложных липидных метаболитов в плазме у пациентов с ME / CFS ( 84 ). Другой анализ продемонстрировал устойчивый гипо-метаболический ответ у пациентов с болезнью ( 95). Это состояние, похожее на суровое, может быть вызвано воздействием неблагоприятных условий окружающей среды, как и следовало ожидать, если иммунная система ME / CFS изо всех сил пытается управлять дисбиозом микробиома и связанными с ним патогенами.
Диаграмма Венна для качественного распределения белков, идентифицированных в спинномозговой жидкости от нормальных контрольных субъектов и субъектов ME / CFS. Семьсот тридцать восемь из 2783 идентифицированных белков (26,5%) были уникальными для пациентов с ME / CFS. Количество белков для каждой категории отдельно показано за пределами кружков (2630 для нормальных контролей, 2783 для ME / CFS) ( 94 ).
Исследования метаболома часто проводятся с целью выявления специфических для заболевания биомаркеров. Однако метаболом также может быть подвергнут скринингу на наличие метаболитов, которые непосредственно индуцируют или подавляют биологическую функцию у пациентов с данным заболеванием. Эти исследования помогают отделить причину от следствия и учесть возможную модуляцию фенотипа заболевания. Например, Johnson et al. ( 96 ) исследовали метаболическое влияние микробных биопленок на ткани рака толстой кишки и связанные с этим случаи возникновения рака. Они обнаружили, что повышенная регуляция метаболита полиамида, полученного из биопленки, усиливает образование биопленки и рост рака.
Микробы действуют по-разному в зависимости от соседних видов и иммунного статуса
Исследования активности микробиома должны учитывать тот факт, что патогенные микроорганизмы, обнаруживаемые у пациентов с ME / CFS, также регулярно выявляются у здоровых людей или у пациентов с сопутствующими воспалительными состояниями. Это особенно верно в отношении исследований, в которых проводился поиск EBV, HHV6, цитомегаловируса и других вирусов, которые можно идентифицировать с помощью ПЦР и / или тестирования антител в когортах ME / CFS. Эта та же самая тенденция, вероятно, сохранится для менее изученных или неопознанных человеческих микробов и вирусов. Хотя эти «частично совпадающие» результаты часто рассматриваются как проблемные, они имеют смысл в свете исследований, которые проясняют, как по-разному действуют микробы в зависимости от иммунного статуса хозяина, соседних видов и широкого спектра других переменных.
В самом деле, большинство человеческих микробов пробионты: они могут изменить их экспрессию генов , чтобы выступать в качестве патогенов в условиях дисбаланса и иммуносупрессии ( 98 - 100). Например, S. pneumoniae может сохраняться в качестве высокоадаптированного комменсала или вирулентного патогена в зависимости от его способности избегать иммунного ответа хозяина ( 101). S. aureus вызывает целый ряд заболеваний, от кожных инфекций до угрожающих жизни заболеваний, таких как эндокардит и менингит. Тем не менее, ~ 30% здоровой человеческой популяции носит S. aureus как члена нормального назального микробиома ( 102 ). Вирулентность S. aureus в этих сообществах определяется рядом факторов, включая сигнальные и конкурентные стратегии, используемые соседними микробами.
То же самое относится и к Escherichia coli (E. coli) , которая также сохраняется в многочисленных формах. Одно исследование показало, что «комменсальная» кишечная палочка может эволюционировать в вирулентные клоны менее чем за 500 поколений ( 103 ). Для большинства микробов эта эволюция в сторону патогенности происходит посредством приобретения новых генов или изменения существующего генома таким образом, который вызывает потерю генов ( 104 ). Например, потеря mucA увеличивает способность Pseudomonas aeruginosa избегать фагоцитоза и противостоять легочному клиренсу ( 105 ).
Следует также отметить, что каждый вид микробов представляет множество различных штаммов, каждый из которых может различаться по набору генов, которые он кодирует, или по количеству копий таких генов. Эта внутривидовая изменчивость наделяет каждый штамм различными функциональными возможностями, включая различия в вирулентности, подвижности, использовании питательных веществ и лекарственной устойчивости ( 106 ). Гринблюм и соавт. ( 106) выявили значительные изменения числа копий на уровне штамма у разных видов в метагеномных образцах, полученных от пациентов с синдромом раздраженного кишечника. Это особенно верно в отношении генов, связанных с конкретными функциями сообщества, включая функции, связанные с образом жизни сообщества. Различия в количестве копий генов также влияли на адаптивные функции, связанные с ожирением. Яо и соавт. ( 107обнаружил, что делеция одного гена Bacteriodes - и гидролазы желчной соли, которую он экспрессирует - изменяет метаболизм хозяина таким образом, что влияет на управление весом, циркадный ритм и иммунитет.
Расположение микробов или вирусов также может влиять на его активность. Например, большая часть человеческого населения является носителями HHV-6. Однако при болезни Альцгеймера HHV-6A был недавно идентифицирован в ткани головного мозга человека ( 88 ). Там было показано, что его активность способна регулировать молекулярные, клинические и нейропатологические сети хозяина таким образом, который может способствовать воспалению и потере нейронов. VanElzakker ( 108 ) предположил, что HHV-6 может также инфицировать блуждающий нерв при ME / CFS, что приводит к измененной передаче сигналов по оси кишки и головному мозгу у пациентов с болезнью.
Иммунная система человека также играет центральную роль в определении активности микроорганизмов и вирусов. Надежный иммунный ответ часто способен контролировать вирулентность патогена. Однако, если патогенные микроорганизмы преодолевают иммунный ответ или иммунная система подавляется лекарственными средствами, химическими веществами или другими факторами окружающей среды, патобионты с большей вероятностью изменяют экспрессию своего гена таким образом, который способствует развитию болезни.
Патобионты изменяют свою общую экспрессию генов, чтобы стимулировать дисбактериоз
Патобионты могут нарушать иммунный ответ человека, коллективно изменяя экспрессию своего гена. Йост и др. ( 100 ) провели превосходный анализ обогащения генной онтологией (GO) микробиома полости рта во время прогрессирования пародонта. В течение двухмесячного периода исследования изменения в метагеноме не прогрессирующих сайтов были незначительными. Однако активные места, которые прогрессировали до периодонтита, характеризовались многочисленными функциональными геномными признаками. Фактически, команда сообщила о полной перестройке на уровне метагенома между исходными участками, которые прогрессировали до периодонтита, и теми, которые этого не сделали.
Термины GO, связанные с процессами, включая биосинтез пептидогликана и транспорт калия, были сильно обогащены в исходных точках, которые позднее перешли в периодонтит. Гены, контролирующие подвижность ресничек, и CRISPR-ассоциированные белки также были активны на начальных стадиях прогрессирования заболевания. В точке разрыва активные сайты экспрессировали гены, связанные с транспортом двухвалентного железа и реакцией на окислительный стресс. Прогрессирование до периодонтита также коррелировало с повышенной экспрессией предполагаемых факторов вирулентности, связанных с рядом видов бактерий. Микоплазма, бактериофаг и вирусная активность эукариот были выше в прогрессирующих участках по сравнению с исходными образцами.
Команда пришла к выводу, что прогрессирование пародонтита обусловлено всем микробным сообществом полости рта, а не несколькими избранными патогенными микроорганизмами. В действительности, в условиях усиливающегося воспаления и дисбаланса все оралльное сообщество, по-видимому, действует как единый патоген. Действительно, группы бактерий, которые обычно не считаются патогенами, активируют большое количество предполагаемых факторов вирулентности в активных центрах. К ним относится Veillonella parvula , микроб, почти всегда связанный со здоровьем зубов.
Внутриклеточный дисбактериоз микробиома
Изменения вирулентности микробиомов по всему сообществу часто обусловлены доминирующими патогенами - организмами, которые становятся центральными компонентами микробиома, подавляя рост и активность комменсалов ( 109 ). В других случаях основные патогенные микроорганизмы способствуют воспалению, даже когда присутствуют в качестве количественно незначительных членов микробиома. Например, P. gingivalis часто составляет всего 0,01% биопленок пародонта, но в то же время вызывает деструктивные изменения во взаимодействии микроорганизмов-хозяев, глубоко нарушая врожденный иммунный ответ ( 110 ).
Патогенные микроорганизмы, способные сохраняться в клетках иммунной системы, имеют уникальную возможность управлять воспалительными заболеваниями ( 111 ). Действительно, большинство хорошо охарактеризованных патогенов, включая многие, связанные с ME / CFS, способны к внутриклеточной персистенции ( 112 ). По выжить в этой моде, то они могут непосредственно мешать человеческой транскрипции, трансляции и репарации ДНК процессов (рис (рис.3).3 ). Патогены в цитоплазме клетки могут дополнительно нарушать регуляцию эпигенетической среды ( 113 ). Например, после заражения макрофагами Mycobacterium tuberculosis изменяет экспрессию 463 генов человека ( 114 ). H. pylori инфекция предрасполагает к нестабильности генома и повреждению ДНК, в том числе к двойным разрывам ( 115 ). EBV-инфекция B-клеток также может способствовать постоянному повреждению ДНК человека ( 116 ).
Внутриклеточные патогены и белки / метаболиты, которые они экспрессируют, могут напрямую вмешиваться в процессы транскрипции, трансляции и репарации ДНК человека.
Тысячи метаболитов и белков, экспрессируемых внутриклеточными патогенами, также взаимодействуют с геномом хозяина, дополнительно изменяя экспрессию генов человека таким образом, который способствует заболеванию. Даже пептиды, чувствительные к бактериальному кворуму, могут нарушать регуляцию активности человеческого пути. Wynendaele et al. ( 117 ) обнаружили, что чувствительные к кворуму молекулы, созданные грамотрицательными бактериями, изменяют экспрессию генов человека таким образом, который способствует ангиогенезу in vitro , росту опухоли и неоваскуляризации при раке толстой кишки.
Внутриклеточные патогены могут также перемещаться между клетками через недавно охарактеризованные туннельные нанотрубки (ТНТ) ( 118 , 119 ). Эти цитоплазматические удлинения дендритных клеток, глиальных клеток и родственных клеток человека позволяют осуществлять внутриклеточный перенос микроРНК, РНК-мессенджеров, прионов, вирусов и даже целых органелл, таких как митохондрии ( 120 , 121 ). Например, образование индуцированных ВИЧ туннельных нанотрубок, по-видимому, опосредует примерно половину распространения вируса ВИЧ среди макрофагов, происходящих из моноцитов ( 119 ).
Молекулярная Мимикрия
Дисфункция, вызванная внутриклеточной инфекцией, усугубляется тем фактом, что микробные белки и метаболиты часто идентичны или сходны по структуре с теми, которые создаются их человеческими хозяевами. Молекулярная мимикрия или гомология последовательностей между этими белками и метаболитами делает все более трудным для человека голобионта распознавать «чужое» из «себя».
Например, Altindis et al. ( 122 ) обнаружили, что вирусы несут последовательности со значительной гомологией с человеческими инсулиноподобными факторами роста (VILP). Эти VILP могут связываться с человеческими и мышиными рецепторами IGF-1 in vitro , что приводит к аутофосфорилированию и передаче сигналов вниз по течению. E. coli содержит большую разнообразную сеть белков, которые активно способствуют повреждению эндогенной ДНК в клетках ( 123 ). Однако, по крайней мере, 280 из этих ДНК-повреждающих белков имеют человеческие гомологи, которые также способствуют повреждению ДНК и мутагенезу у человека-хозяина.
Действительно, избыточность между человеческими и микробными метаболитами, белками и путями настолько велика, что потенциал молекулярной мимикрии вносить вклад в иммунную и метаболическую дисфункцию хозяина полубесконечен. Например, вирусные везикулы и внеклеточные везикулы человека (EV) имеют значительное структурное и функциональное сходство ( 124 ). Эти сходства настолько обширны, что трудно отличить вирусы от (неинфекционных) вирусов.
...
Состав протеома человека и метаболома отражают микробиом и активность
Поскольку многие из белков и метаболитов в человеческом голобионте имеют микробное происхождение, состав протеома ME / CFS и метаболом изменяются в зависимости от видового состава
микробиома. Протеомный и метаболомный анализы дополнительно отражают активность микробиома. Это связано с тем, что микробы и вирусы часто изменяют свою экспрессию генов так, что со временем они экспрессируют различные белки и метаболиты. Геном человека и связанные с ним эпигенетические изменения также вносят вклад в метаболическое разнообразие, хотя высокий уровень избыточности между человеческими и микробными метаболитами может затруднить выявление происхождения этих ассоциаций.
Schutzer et al. ( 94 ) показал , что цереброспинальный протеом ME / CFS существенно отличается от здорового (рис (Figure2).2 ). Действительно, 738 из 2783 идентифицированных белков (26,5%) были уникальными для пациентов с ME / CFS, предоставляя убедительные доказательства того, что ME / CFS действительно характеризуется дисбиозом микробиома в ткани и крови. Также было показано, что состав метаболома крови изменяется в ME / CFS. В одном из таких исследований сообщалось о повышенном уровне холина, карнитина и сложных липидных метаболитов в плазме у пациентов с ME / CFS ( 84 ). Другой анализ продемонстрировал устойчивый гипо-метаболический ответ у пациентов с болезнью ( 95). Это состояние, похожее на суровое, может быть вызвано воздействием неблагоприятных условий окружающей среды, как и следовало ожидать, если иммунная система ME / CFS изо всех сил пытается управлять дисбиозом микробиома и связанными с ним патогенами.
Диаграмма Венна для качественного распределения белков, идентифицированных в спинномозговой жидкости от нормальных контрольных субъектов и субъектов ME / CFS. Семьсот тридцать восемь из 2783 идентифицированных белков (26,5%) были уникальными для пациентов с ME / CFS. Количество белков для каждой категории отдельно показано за пределами кружков (2630 для нормальных контролей, 2783 для ME / CFS) ( 94 ).
Микробы действуют по-разному в зависимости от соседних видов и иммунного статуса
Исследования активности микробиома должны учитывать тот факт, что патогенные микроорганизмы, обнаруживаемые у пациентов с ME / CFS, также регулярно выявляются у здоровых людей или у пациентов с сопутствующими воспалительными состояниями. Это особенно верно в отношении исследований, в которых проводился поиск EBV, HHV6, цитомегаловируса и других вирусов, которые можно идентифицировать с помощью ПЦР и / или тестирования антител в когортах ME / CFS. Эта та же самая тенденция, вероятно, сохранится для менее изученных или неопознанных человеческих микробов и вирусов. Хотя эти «частично совпадающие» результаты часто рассматриваются как проблемные, они имеют смысл в свете исследований, которые проясняют, как по-разному действуют микробы в зависимости от иммунного статуса хозяина, соседних видов и широкого спектра других переменных.
В самом деле, большинство человеческих микробов пробионты: они могут изменить их экспрессию генов , чтобы выступать в качестве патогенов в условиях дисбаланса и иммуносупрессии ( 98 - 100). Например, S. pneumoniae может сохраняться в качестве высокоадаптированного комменсала или вирулентного патогена в зависимости от его способности избегать иммунного ответа хозяина ( 101). S. aureus вызывает целый ряд заболеваний, от кожных инфекций до угрожающих жизни заболеваний, таких как эндокардит и менингит. Тем не менее, ~ 30% здоровой человеческой популяции носит S. aureus как члена нормального назального микробиома ( 102 ). Вирулентность S. aureus в этих сообществах определяется рядом факторов, включая сигнальные и конкурентные стратегии, используемые соседними микробами.
То же самое относится и к Escherichia coli (E. coli) , которая также сохраняется в многочисленных формах. Одно исследование показало, что «комменсальная» кишечная палочка может эволюционировать в вирулентные клоны менее чем за 500 поколений ( 103 ). Для большинства микробов эта эволюция в сторону патогенности происходит посредством приобретения новых генов или изменения существующего генома таким образом, который вызывает потерю генов ( 104 ). Например, потеря mucA увеличивает способность Pseudomonas aeruginosa избегать фагоцитоза и противостоять легочному клиренсу ( 105 ).
Следует также отметить, что каждый вид микробов представляет множество различных штаммов, каждый из которых может различаться по набору генов, которые он кодирует, или по количеству копий таких генов. Эта внутривидовая изменчивость наделяет каждый штамм различными функциональными возможностями, включая различия в вирулентности, подвижности, использовании питательных веществ и лекарственной устойчивости ( 106 ). Гринблюм и соавт. ( 106) выявили значительные изменения числа копий на уровне штамма у разных видов в метагеномных образцах, полученных от пациентов с синдромом раздраженного кишечника. Это особенно верно в отношении генов, связанных с конкретными функциями сообщества, включая функции, связанные с образом жизни сообщества. Различия в количестве копий генов также влияли на адаптивные функции, связанные с ожирением. Яо и соавт. ( 107обнаружил, что делеция одного гена Bacteriodes - и гидролазы желчной соли, которую он экспрессирует - изменяет метаболизм хозяина таким образом, что влияет на управление весом, циркадный ритм и иммунитет.
Расположение микробов или вирусов также может влиять на его активность. Например, большая часть человеческого населения является носителями HHV-6. Однако при болезни Альцгеймера HHV-6A был недавно идентифицирован в ткани головного мозга человека ( 88 ). Там было показано, что его активность способна регулировать молекулярные, клинические и нейропатологические сети хозяина таким образом, который может способствовать воспалению и потере нейронов. VanElzakker ( 108 ) предположил, что HHV-6 может также инфицировать блуждающий нерв при ME / CFS, что приводит к измененной передаче сигналов по оси кишки и головному мозгу у пациентов с болезнью.
Иммунная система человека также играет центральную роль в определении активности микроорганизмов и вирусов. Надежный иммунный ответ часто способен контролировать вирулентность патогена. Однако, если патогенные микроорганизмы преодолевают иммунный ответ или иммунная система подавляется лекарственными средствами, химическими веществами или другими факторами окружающей среды, патобионты с большей вероятностью изменяют экспрессию своего гена таким образом, который способствует развитию болезни.
Патобионты изменяют свою общую экспрессию генов, чтобы стимулировать дисбактериоз
Патобионты могут нарушать иммунный ответ человека, коллективно изменяя экспрессию своего гена. Йост и др. ( 100 ) провели превосходный анализ обогащения генной онтологией (GO) микробиома полости рта во время прогрессирования пародонта. В течение двухмесячного периода исследования изменения в метагеноме не прогрессирующих сайтов были незначительными. Однако активные места, которые прогрессировали до периодонтита, характеризовались многочисленными функциональными геномными признаками. Фактически, команда сообщила о полной перестройке на уровне метагенома между исходными участками, которые прогрессировали до периодонтита, и теми, которые этого не сделали.
Термины GO, связанные с процессами, включая биосинтез пептидогликана и транспорт калия, были сильно обогащены в исходных точках, которые позднее перешли в периодонтит. Гены, контролирующие подвижность ресничек, и CRISPR-ассоциированные белки также были активны на начальных стадиях прогрессирования заболевания. В точке разрыва активные сайты экспрессировали гены, связанные с транспортом двухвалентного железа и реакцией на окислительный стресс. Прогрессирование до периодонтита также коррелировало с повышенной экспрессией предполагаемых факторов вирулентности, связанных с рядом видов бактерий. Микоплазма, бактериофаг и вирусная активность эукариот были выше в прогрессирующих участках по сравнению с исходными образцами.
Команда пришла к выводу, что прогрессирование пародонтита обусловлено всем микробным сообществом полости рта, а не несколькими избранными патогенными микроорганизмами. В действительности, в условиях усиливающегося воспаления и дисбаланса все оралльное сообщество, по-видимому, действует как единый патоген. Действительно, группы бактерий, которые обычно не считаются патогенами, активируют большое количество предполагаемых факторов вирулентности в активных центрах. К ним относится Veillonella parvula , микроб, почти всегда связанный со здоровьем зубов.
Внутриклеточный дисбактериоз микробиома
Изменения вирулентности микробиомов по всему сообществу часто обусловлены доминирующими патогенами - организмами, которые становятся центральными компонентами микробиома, подавляя рост и активность комменсалов ( 109 ). В других случаях основные патогенные микроорганизмы способствуют воспалению, даже когда присутствуют в качестве количественно незначительных членов микробиома. Например, P. gingivalis часто составляет всего 0,01% биопленок пародонта, но в то же время вызывает деструктивные изменения во взаимодействии микроорганизмов-хозяев, глубоко нарушая врожденный иммунный ответ ( 110 ).
Патогенные микроорганизмы, способные сохраняться в клетках иммунной системы, имеют уникальную возможность управлять воспалительными заболеваниями ( 111 ). Действительно, большинство хорошо охарактеризованных патогенов, включая многие, связанные с ME / CFS, способны к внутриклеточной персистенции ( 112 ). По выжить в этой моде, то они могут непосредственно мешать человеческой транскрипции, трансляции и репарации ДНК процессов (рис (рис.3).3 ). Патогены в цитоплазме клетки могут дополнительно нарушать регуляцию эпигенетической среды ( 113 ). Например, после заражения макрофагами Mycobacterium tuberculosis изменяет экспрессию 463 генов человека ( 114 ). H. pylori инфекция предрасполагает к нестабильности генома и повреждению ДНК, в том числе к двойным разрывам ( 115 ). EBV-инфекция B-клеток также может способствовать постоянному повреждению ДНК человека ( 116 ).
Внутриклеточные патогены и белки / метаболиты, которые они экспрессируют, могут напрямую вмешиваться в процессы транскрипции, трансляции и репарации ДНК человека.
Тысячи метаболитов и белков, экспрессируемых внутриклеточными патогенами, также взаимодействуют с геномом хозяина, дополнительно изменяя экспрессию генов человека таким образом, который способствует заболеванию. Даже пептиды, чувствительные к бактериальному кворуму, могут нарушать регуляцию активности человеческого пути. Wynendaele et al. ( 117 ) обнаружили, что чувствительные к кворуму молекулы, созданные грамотрицательными бактериями, изменяют экспрессию генов человека таким образом, который способствует ангиогенезу in vitro , росту опухоли и неоваскуляризации при раке толстой кишки.
Внутриклеточные патогены могут также перемещаться между клетками через недавно охарактеризованные туннельные нанотрубки (ТНТ) ( 118 , 119 ). Эти цитоплазматические удлинения дендритных клеток, глиальных клеток и родственных клеток человека позволяют осуществлять внутриклеточный перенос микроРНК, РНК-мессенджеров, прионов, вирусов и даже целых органелл, таких как митохондрии ( 120 , 121 ). Например, образование индуцированных ВИЧ туннельных нанотрубок, по-видимому, опосредует примерно половину распространения вируса ВИЧ среди макрофагов, происходящих из моноцитов ( 119 ).
Молекулярная Мимикрия
Дисфункция, вызванная внутриклеточной инфекцией, усугубляется тем фактом, что микробные белки и метаболиты часто идентичны или сходны по структуре с теми, которые создаются их человеческими хозяевами. Молекулярная мимикрия или гомология последовательностей между этими белками и метаболитами делает все более трудным для человека голобионта распознавать «чужое» из «себя».
Например, Altindis et al. ( 122 ) обнаружили, что вирусы несут последовательности со значительной гомологией с человеческими инсулиноподобными факторами роста (VILP). Эти VILP могут связываться с человеческими и мышиными рецепторами IGF-1 in vitro , что приводит к аутофосфорилированию и передаче сигналов вниз по течению. E. coli содержит большую разнообразную сеть белков, которые активно способствуют повреждению эндогенной ДНК в клетках ( 123 ). Однако, по крайней мере, 280 из этих ДНК-повреждающих белков имеют человеческие гомологи, которые также способствуют повреждению ДНК и мутагенезу у человека-хозяина.
Действительно, избыточность между человеческими и микробными метаболитами, белками и путями настолько велика, что потенциал молекулярной мимикрии вносить вклад в иммунную и метаболическую дисфункцию хозяина полубесконечен. Например, вирусные везикулы и внеклеточные везикулы человека (EV) имеют значительное структурное и функциональное сходство ( 124 ). Эти сходства настолько обширны, что трудно отличить вирусы от (неинфекционных) вирусов.
...