TR_Sanchez
Известный человек
- Сообщения
- 991
- Лайки
- 763
- Баллы
- 108
Очень важный текст.
Про вестерн-блоты.
Как известно, результат иммуноблота можно получить в «качественном» виде — Выявлено/ Сомнительно/ Не выявлено — и в «количественном», с числами напротив каждого белка в бланке результата. Как какая лаборатория захочет. Автоматические анализаторы, и, соответственно, тест-системы иммуноблотов почти везде EUROIMMUN. Исключение — ДНК-лаборатория в Киеве с системами DiaSorin и LIAISON, и CMD — у них иммуночип собственной разработки.
----------------
Небольшое отступление для тех, кто только-только столнулся с лаймом. Поясню пару названий.
Сонификат боррелий: их выращивают на специальной питательной среде и затем с помощью ультразвука разрушают до отдельных белков.
Вестерн-блот: классическая технология, когда сонификат боррелий (смесь всех белков, из которых состоит боррелия) с помощью постоянного электрического тока (как при электрофорезе) распределяется по акриламидному гелю. Белки с большей массой преодолеют в геле меньший путь за отведённое время, более легкие белки, соответственно, продвинутся дальше. Затем эти распределенные белки, как есть, переносят с геля на целлюлозную мембрану. Это всё можно посмотреть, ясное дело, на Ютубе, и почитать. На мембрану наносят исследуюмую сыворотку крови, антитела связываются с белками. Еще пара реактивов — и в конце процедуры получается полоска тестовой мембраны, на которой окрашены места, в которых белки прореагировали с антителами. Белки ведь собраны в более-менее одном месте соответственно своей массе, распределены по мембране от самых легких до самых тяжелых. И эти окрашенные места образуют т. н. «полосы вестерн-блота», в англоязычной литературе — «bands». Чем больше антител к какому-то белку в крови, тем темнее будет полоса.
Недостаток вестерн-блота: одну и ту же атомную массу может иметь не один белок, и все они будут на мембране в одном месте. Белки есть специфические — присутствующие, в данном случае, только у боррелии, и неспецифические — имеются также и у других микроорганизмов.
Лайн-блот: Более продвинутый анализ, чем вестерн-блот. Берут точно отмерянное количество белка боррелии, наносят на тестовую мембрану в точное место в виде полоски, линии (англ. line, «лайн»). Белки при этом могут быть использованы рекомбинантные — полученные искуственно. Преимущество лайн-блота: отсутствуют неспецифические белки. В лайн-блоты EUROIMMUN, согласно описанию тест-систем, включены рекомбинантные белки для повышения специфичности анализа.
Иммуночип разработки CMD: тот же лайн-блот, только мембрана не в виде полоски, а прямоугольная, белки наносят не в ряд, а матрицей (как таблетки), и, возможно (только предположение), штамм боррелии отличный от евроиммуновского.
Иммуноблот: другое название вестерн-блота, лайн-блота, да и иммуночип это то же самое.
Блот: народное сокращение для иммуноблота.
Чувствительность: вероятность выявления антител к данному белку, при его использовании в иммуноблоте.
Специфичность: процент гарантии, что выявлены антитела именно к данному белку, а не к какому-то похожему.
----------------
Как отличить вестерн-блот от лайн-блота по спектру белков: в лайн-блоте EUROIMMUN есть три белка OspC в IgM и три VlsE в IgG разных видов боррелий — B. afzelii, B. garinii и B. burgdorferi s.s., а в вестерн-блоте OspC и VlsE по одному. Существует ещё лайн-блот с четвертым белком OspC B. spielmanii, в Минске в Инвитро (и в других городах в Белоруссии по идее), в Польше.
Тест-системы EUROIMMUN называются:
Вестерн-блот — Anti-Borrelia EUROLINE-WB
Лайн-блот с тремя OspC — Anti-Borrelia EUROLINE-RN-AT
Лайн-блот с четырьмя OspC (улучшенными) — Anti-Borrelia EUROLINE-RN-AT-adv
Изображение тестовой мембраны обрабатывается программным обеспечением EUROIMMUN — оценивается оптическая плотность полос иммуноблота, т. е. насколько они темные, а значит, как много есть в крови антител, прореагировавших с белками на мембране. Результат выдается в виде чисел.
0-11 Отрицательный
12-18 Сомнительный/ Пограничный
19-256 Положительный
В Польше референсные значения соответственно 0-15, 16-25, 26-255, почему-то отличаются.
Блот в «количественном» виде (вообще-то правильно такой результат с оценкой оптической плотности называть полуколичественным, что и делает, например, Centrolab, но в народе уже сложилось понятие «количественный блот») выдают следующие лаборатории:
Инвитро (Минск, ну, и, вероятно, в других городах Белорусии, я просто помню, что видел блот из Минска) — лайн-блот, но только IgM.
ALAB, Diagnostyka и, может, какие другие тоже (Польша).
Медлаб, УЛДЦ, Centrolab, Савон, Прима МЕД, Astra-Dia, Эскулаб (Украина).
Кажется, в Молдавии в Инвитро иммуноблот тоже «количественный», но это не точно, т.е не помню.
«Качественный» блот: все остальные. Т.е. в России — все.
Отдельно сейчас выделился Хеликс. В их бланке может быть указано содержание антител к антигену (белку): высокое, среднее или низкое. На сегодня пришлось видеть пока только один анализ из Хеликса, в нём в положительных результатах стоит «1+», что, должно быть, означает «низкое содержание антител». В некоторых лабораториях в бланках положительный диапазон делится на четыре поддиапазона, которые обозначаются плюсами, соответственно может быть от одного до четырех плюсов. Бланк иммуноблота с плюсами видел из Польши, и в США такие есть, например, у Айдженекс. В Хеликсе, значит, три поддиапазона. Хоть что-то.
Но. Некоторые лаборатории выдают оригинальный бланк, созданный компьютерной программой EUROIMMUN. Это УЛДЦ, Centrolab и Инвитро Минск (а может, и во всей Белоруссии), еще клиника Симеста в Одессе и какая-то лаборатория в Запорожье, название не помню. Ценность оригинального бланка в том, что в нем есть изображение самой тестовой мембраны! На ней можно увидеть те самые полосы вестерн-блота (см., например, лекцию Дж. Бурраскано 4.02.2021). Т.е можно увидеть все белки (да, антитела, а не белки, но в народе, опять таки, сложилось название «белки»), некоторые из них неспецифические.
Видя тестовую мембрану, можно с гораздо большей уверенностью говорить о положительности блота. При заражении боррелией почти всегда есть много других полос, кроме указанных в таблице, особенно на поздних стадиях.
Такой блот с оригинальным бланком можно использовать для отслеживания роста антител и появления антител к новым белкам на ранней стадии [в первые две-три недели после укуса можно и нужно сдавать ИФА или CLIA (хемилюминесцентный метод) с количественым представлением результата, несколько раз, на 5-й — 7-й день, и потом еще раза три, через 3 дня, и смотреть на динамику, но об этом ниже].
Можно отслеживать снижение антител после лечения, динамику в процессе лечения.
Над изображением тестовой мембраны на бланке указаны белки, вошедшие в таблицу. Как угадать или узнать, где какой белок. В первую очередь понятно, какая полоса принадлежит p41, она сразу справа от p39, и часто она очень широкая и темная. Хоть p41 и может давать перекрест, например, с ВЭБ, но очень высокие антитела к этому белку (флагеллину) говорят об инфекции Borrelia burgdorferi, на этот счет есть исследование на Pubmed где-то за 1993-й год. Можно догадаться, что есть полоса p18. Справа от p31 часто есть полоса, и это может быть p34. Пришлось раз видеть где-то, что VlsE имеет массу 34 kDa, т. е. возможно, там 2 белка как минимум. Слева от p30 бывает полоса, и это может быть p28, но он неспецифический. Справа от p41 очень много разных белков, но среди них есть неспецифические, такие как p66. Слева от p17 бывают полосы, это могут быть p14 и p15.
Много не угадаешь. Еще оригинальный бланк EUROIMMUN выдает Borrelia Centrum в Бухаресте, и у них в таблице намного больше белков! Всего-то нужно поставить галочки в настройках. Видел этот блот в болгарской группе в Фейсбуке. Борелиоза Лаймска болест в България - Borrelia (толковая группа, толковый админ, рекомендую). Дальше — дело Фотошопа, совместить мембрану, скажем, из Centrolab, с мембраной из Бухарестского Borrelia Centrum (там, кстати, доктор Ion, который, как пишут болгары, некоторых вылечил вроде, а у самих у них в Болгарии глухо совсем; у них классика — есть проф. Попов, который лечит боррелиоз несколькими неделями одного антибиотика).
Много обнаруженных белков — это говорит о заражении.
Такие бланки с тестовой мембраной не выдают нигде в мире, только там, где я перечислил.
Так вот, в чём была задумка, ради чего это всё написано.
Как я уже написал выше, во всех лабораториях в России, кроме Хеликса, иммуноблот выдают «качественный», Выявлено — Не выявлено. Но результаты-то лаборанты видят в количественном виде! (Да, правильно говорить в полуколичественном, см. примечание выше).
Мысль в следующем — просить в лабораториях этот самый оригинальный бланк EUROIMMUN.
Таким образом получить количественный иммуноблот.
И тогда можно увидеть, что белок, например, бывает, на 1-2 единицы не дотянул до положительного или сомнительного. Сомнительный результат может быть разным, и 12, и 18. Но если он ближе к положительному (чего вы не увидите в «качественном» иммуноблоте), то это дополнительно говорит в пользу заражения боррелией. Да и 12-13 тоже говорит, особенно если белок высокоспецифичный. Или 11, в отрицательном диапазоне. Был бы на 1 больше, был бы сомнительным. «При чтении блотов сомнительные результаты засчитываем как положительные» (с) — врач-инфекционист о блотах на боррелию. А еще, как писала та же врач, низкий показатель антител не обязательно означает, что их мало. Антитела могут быть свободном состоянии в крови, и могут быть связаны в иммунных комплексах с белками борреллии, а имеющиеся иммуноблоты и ИФА определяют только свободные антитела (иммуноблот с предварительным разбитием иммунных комплексов тоже существует, но в Европе; что есть здесь где-то в научных учреждениях, мне не известно).
Как известно, «главный» антиген в серодиагностике боррелиоза — это VlsE. Есть VlsE — есть лайм. Бывает, он в блоте 9-10-11, и при «качественном» представлении результатов будет написано просто «Не выявлено», а в «количественном блоте» вы увидите, что антитела к нему есть. Тем более, даже в системе Euroline-WB, где используется сонификат боррелии, этот белок VlsE нанесен на отдельную вставку на мембране, и сам он рекомбинантный, т. е. получен искусственно с помощью генной инженерии, а значит, риски ложноположительной реакции почти исключается.
Вообще, высокоспецифичные белки вроде VlsE, p39 в Euroline-WB, или p20, p21, p58 в Euroline-RN-AT, я считаю (да, я пришёл к такому выводу!), нужно засчитывать, даже если они не дотягивают до сомнительного. Показатель 9-10-11 так точно. И смотреть на количество белков, к которым обнаружены антитела. Чем их больше, даже в негативном диапазоне, тем больше иммуноблот подтверждает заражение. Я сейчас о первичной диагностике, не о пересдаче блота в процессе или после лечения.
Еще бывают блоты, в которых напротив каждого белка небольшое число. Я думаю (пока гипотеза), что это не погрешность, не «шум», а просто антитела к боррелии.
В случае успешного лечения можно ожидать, что при пересдаче блотов через определенное количество месяцев, полосы будут бледнеть. IgM так вообще должны уйти по идее.
Между прочим. Критерии CDC действительны только в США, а в Европе свои критерии. Даже один p41, но высокий, говорит о заражении. Источник не помню уже, вроде «Lyme borreliosis» под ред. D. Lipsker и B. Jaulhac. На archive.org
Есть книга «Lyme Disease» под ред. Ali Karami на англ. языке (распространяется свободно), в ней есть описание метода, который предложили Андраш Лакош и Эржебет Игари: сравнивать вестерн-блоты через полгода для оценки лечения или подтверждения заражения. Они, конечно, выводы неправильные сделали, курсы «лечения» по паре недель вылечить не могли в тех случаях, но зато в книге можно посмотреть на множество примеров мембран вестерн-блота. Там только одному новорожденному младенцу, похоже, повезло, но и то неизвестно, не заразили ли его впоследствии.
Блоты из Бухареста — прикреплены в файлах.
Про вестерн-блоты.
Как известно, результат иммуноблота можно получить в «качественном» виде — Выявлено/ Сомнительно/ Не выявлено — и в «количественном», с числами напротив каждого белка в бланке результата. Как какая лаборатория захочет. Автоматические анализаторы, и, соответственно, тест-системы иммуноблотов почти везде EUROIMMUN. Исключение — ДНК-лаборатория в Киеве с системами DiaSorin и LIAISON, и CMD — у них иммуночип собственной разработки.
----------------
Небольшое отступление для тех, кто только-только столнулся с лаймом. Поясню пару названий.
Сонификат боррелий: их выращивают на специальной питательной среде и затем с помощью ультразвука разрушают до отдельных белков.
Вестерн-блот: классическая технология, когда сонификат боррелий (смесь всех белков, из которых состоит боррелия) с помощью постоянного электрического тока (как при электрофорезе) распределяется по акриламидному гелю. Белки с большей массой преодолеют в геле меньший путь за отведённое время, более легкие белки, соответственно, продвинутся дальше. Затем эти распределенные белки, как есть, переносят с геля на целлюлозную мембрану. Это всё можно посмотреть, ясное дело, на Ютубе, и почитать. На мембрану наносят исследуюмую сыворотку крови, антитела связываются с белками. Еще пара реактивов — и в конце процедуры получается полоска тестовой мембраны, на которой окрашены места, в которых белки прореагировали с антителами. Белки ведь собраны в более-менее одном месте соответственно своей массе, распределены по мембране от самых легких до самых тяжелых. И эти окрашенные места образуют т. н. «полосы вестерн-блота», в англоязычной литературе — «bands». Чем больше антител к какому-то белку в крови, тем темнее будет полоса.
Недостаток вестерн-блота: одну и ту же атомную массу может иметь не один белок, и все они будут на мембране в одном месте. Белки есть специфические — присутствующие, в данном случае, только у боррелии, и неспецифические — имеются также и у других микроорганизмов.
Лайн-блот: Более продвинутый анализ, чем вестерн-блот. Берут точно отмерянное количество белка боррелии, наносят на тестовую мембрану в точное место в виде полоски, линии (англ. line, «лайн»). Белки при этом могут быть использованы рекомбинантные — полученные искуственно. Преимущество лайн-блота: отсутствуют неспецифические белки. В лайн-блоты EUROIMMUN, согласно описанию тест-систем, включены рекомбинантные белки для повышения специфичности анализа.
Иммуночип разработки CMD: тот же лайн-блот, только мембрана не в виде полоски, а прямоугольная, белки наносят не в ряд, а матрицей (как таблетки), и, возможно (только предположение), штамм боррелии отличный от евроиммуновского.
Иммуноблот: другое название вестерн-блота, лайн-блота, да и иммуночип это то же самое.
Блот: народное сокращение для иммуноблота.
Чувствительность: вероятность выявления антител к данному белку, при его использовании в иммуноблоте.
Специфичность: процент гарантии, что выявлены антитела именно к данному белку, а не к какому-то похожему.
----------------
Как отличить вестерн-блот от лайн-блота по спектру белков: в лайн-блоте EUROIMMUN есть три белка OspC в IgM и три VlsE в IgG разных видов боррелий — B. afzelii, B. garinii и B. burgdorferi s.s., а в вестерн-блоте OspC и VlsE по одному. Существует ещё лайн-блот с четвертым белком OspC B. spielmanii, в Минске в Инвитро (и в других городах в Белоруссии по идее), в Польше.
Тест-системы EUROIMMUN называются:
Вестерн-блот — Anti-Borrelia EUROLINE-WB
Лайн-блот с тремя OspC — Anti-Borrelia EUROLINE-RN-AT
Лайн-блот с четырьмя OspC (улучшенными) — Anti-Borrelia EUROLINE-RN-AT-adv
Изображение тестовой мембраны обрабатывается программным обеспечением EUROIMMUN — оценивается оптическая плотность полос иммуноблота, т. е. насколько они темные, а значит, как много есть в крови антител, прореагировавших с белками на мембране. Результат выдается в виде чисел.
0-11 Отрицательный
12-18 Сомнительный/ Пограничный
19-256 Положительный
В Польше референсные значения соответственно 0-15, 16-25, 26-255, почему-то отличаются.
Блот в «количественном» виде (вообще-то правильно такой результат с оценкой оптической плотности называть полуколичественным, что и делает, например, Centrolab, но в народе уже сложилось понятие «количественный блот») выдают следующие лаборатории:
Инвитро (Минск, ну, и, вероятно, в других городах Белорусии, я просто помню, что видел блот из Минска) — лайн-блот, но только IgM.
ALAB, Diagnostyka и, может, какие другие тоже (Польша).
Медлаб, УЛДЦ, Centrolab, Савон, Прима МЕД, Astra-Dia, Эскулаб (Украина).
Кажется, в Молдавии в Инвитро иммуноблот тоже «количественный», но это не точно, т.е не помню.
«Качественный» блот: все остальные. Т.е. в России — все.
Отдельно сейчас выделился Хеликс. В их бланке может быть указано содержание антител к антигену (белку): высокое, среднее или низкое. На сегодня пришлось видеть пока только один анализ из Хеликса, в нём в положительных результатах стоит «1+», что, должно быть, означает «низкое содержание антител». В некоторых лабораториях в бланках положительный диапазон делится на четыре поддиапазона, которые обозначаются плюсами, соответственно может быть от одного до четырех плюсов. Бланк иммуноблота с плюсами видел из Польши, и в США такие есть, например, у Айдженекс. В Хеликсе, значит, три поддиапазона. Хоть что-то.
Но. Некоторые лаборатории выдают оригинальный бланк, созданный компьютерной программой EUROIMMUN. Это УЛДЦ, Centrolab и Инвитро Минск (а может, и во всей Белоруссии), еще клиника Симеста в Одессе и какая-то лаборатория в Запорожье, название не помню. Ценность оригинального бланка в том, что в нем есть изображение самой тестовой мембраны! На ней можно увидеть те самые полосы вестерн-блота (см., например, лекцию Дж. Бурраскано 4.02.2021). Т.е можно увидеть все белки (да, антитела, а не белки, но в народе, опять таки, сложилось название «белки»), некоторые из них неспецифические.
Видя тестовую мембрану, можно с гораздо большей уверенностью говорить о положительности блота. При заражении боррелией почти всегда есть много других полос, кроме указанных в таблице, особенно на поздних стадиях.
Такой блот с оригинальным бланком можно использовать для отслеживания роста антител и появления антител к новым белкам на ранней стадии [в первые две-три недели после укуса можно и нужно сдавать ИФА или CLIA (хемилюминесцентный метод) с количественым представлением результата, несколько раз, на 5-й — 7-й день, и потом еще раза три, через 3 дня, и смотреть на динамику, но об этом ниже].
Можно отслеживать снижение антител после лечения, динамику в процессе лечения.
Над изображением тестовой мембраны на бланке указаны белки, вошедшие в таблицу. Как угадать или узнать, где какой белок. В первую очередь понятно, какая полоса принадлежит p41, она сразу справа от p39, и часто она очень широкая и темная. Хоть p41 и может давать перекрест, например, с ВЭБ, но очень высокие антитела к этому белку (флагеллину) говорят об инфекции Borrelia burgdorferi, на этот счет есть исследование на Pubmed где-то за 1993-й год. Можно догадаться, что есть полоса p18. Справа от p31 часто есть полоса, и это может быть p34. Пришлось раз видеть где-то, что VlsE имеет массу 34 kDa, т. е. возможно, там 2 белка как минимум. Слева от p30 бывает полоса, и это может быть p28, но он неспецифический. Справа от p41 очень много разных белков, но среди них есть неспецифические, такие как p66. Слева от p17 бывают полосы, это могут быть p14 и p15.
Много не угадаешь. Еще оригинальный бланк EUROIMMUN выдает Borrelia Centrum в Бухаресте, и у них в таблице намного больше белков! Всего-то нужно поставить галочки в настройках. Видел этот блот в болгарской группе в Фейсбуке. Борелиоза Лаймска болест в България - Borrelia (толковая группа, толковый админ, рекомендую). Дальше — дело Фотошопа, совместить мембрану, скажем, из Centrolab, с мембраной из Бухарестского Borrelia Centrum (там, кстати, доктор Ion, который, как пишут болгары, некоторых вылечил вроде, а у самих у них в Болгарии глухо совсем; у них классика — есть проф. Попов, который лечит боррелиоз несколькими неделями одного антибиотика).
Много обнаруженных белков — это говорит о заражении.
Такие бланки с тестовой мембраной не выдают нигде в мире, только там, где я перечислил.
Так вот, в чём была задумка, ради чего это всё написано.
Как я уже написал выше, во всех лабораториях в России, кроме Хеликса, иммуноблот выдают «качественный», Выявлено — Не выявлено. Но результаты-то лаборанты видят в количественном виде! (Да, правильно говорить в полуколичественном, см. примечание выше).
Мысль в следующем — просить в лабораториях этот самый оригинальный бланк EUROIMMUN.
Таким образом получить количественный иммуноблот.
И тогда можно увидеть, что белок, например, бывает, на 1-2 единицы не дотянул до положительного или сомнительного. Сомнительный результат может быть разным, и 12, и 18. Но если он ближе к положительному (чего вы не увидите в «качественном» иммуноблоте), то это дополнительно говорит в пользу заражения боррелией. Да и 12-13 тоже говорит, особенно если белок высокоспецифичный. Или 11, в отрицательном диапазоне. Был бы на 1 больше, был бы сомнительным. «При чтении блотов сомнительные результаты засчитываем как положительные» (с) — врач-инфекционист о блотах на боррелию. А еще, как писала та же врач, низкий показатель антител не обязательно означает, что их мало. Антитела могут быть свободном состоянии в крови, и могут быть связаны в иммунных комплексах с белками борреллии, а имеющиеся иммуноблоты и ИФА определяют только свободные антитела (иммуноблот с предварительным разбитием иммунных комплексов тоже существует, но в Европе; что есть здесь где-то в научных учреждениях, мне не известно).
Как известно, «главный» антиген в серодиагностике боррелиоза — это VlsE. Есть VlsE — есть лайм. Бывает, он в блоте 9-10-11, и при «качественном» представлении результатов будет написано просто «Не выявлено», а в «количественном блоте» вы увидите, что антитела к нему есть. Тем более, даже в системе Euroline-WB, где используется сонификат боррелии, этот белок VlsE нанесен на отдельную вставку на мембране, и сам он рекомбинантный, т. е. получен искусственно с помощью генной инженерии, а значит, риски ложноположительной реакции почти исключается.
Вообще, высокоспецифичные белки вроде VlsE, p39 в Euroline-WB, или p20, p21, p58 в Euroline-RN-AT, я считаю (да, я пришёл к такому выводу!), нужно засчитывать, даже если они не дотягивают до сомнительного. Показатель 9-10-11 так точно. И смотреть на количество белков, к которым обнаружены антитела. Чем их больше, даже в негативном диапазоне, тем больше иммуноблот подтверждает заражение. Я сейчас о первичной диагностике, не о пересдаче блота в процессе или после лечения.
Еще бывают блоты, в которых напротив каждого белка небольшое число. Я думаю (пока гипотеза), что это не погрешность, не «шум», а просто антитела к боррелии.
В случае успешного лечения можно ожидать, что при пересдаче блотов через определенное количество месяцев, полосы будут бледнеть. IgM так вообще должны уйти по идее.
Между прочим. Критерии CDC действительны только в США, а в Европе свои критерии. Даже один p41, но высокий, говорит о заражении. Источник не помню уже, вроде «Lyme borreliosis» под ред. D. Lipsker и B. Jaulhac. На archive.org
Есть книга «Lyme Disease» под ред. Ali Karami на англ. языке (распространяется свободно), в ней есть описание метода, который предложили Андраш Лакош и Эржебет Игари: сравнивать вестерн-блоты через полгода для оценки лечения или подтверждения заражения. Они, конечно, выводы неправильные сделали, курсы «лечения» по паре недель вылечить не могли в тех случаях, но зато в книге можно посмотреть на множество примеров мембран вестерн-блота. Там только одному новорожденному младенцу, похоже, повезло, но и то неизвестно, не заразили ли его впоследствии.
Блоты из Бухареста — прикреплены в файлах.
Вложения
Последнее редактирование: