В неактивном состоянии вирусы герпеса находятся в клетках или в составе генома, или в виде кольцевидных форм и из клеток не выходят. А вот если они по каким-то причинам начали размножаться, то они выходят из клеток. Там мы их и ловим. И если поймали, то тогда и говорим, что есть активная репликация (размножение). В самих клетках нахождение вирусов герпеса говорит только о факте наличия вирусов в организме, но это не имеет клинического значения.
Слюна в этом отношении гораздо информативнее, чем кровь, так как количество зараженных клеток (а, соответственно, и количество вышедших из них вирусных частиц) в 1 куб.см. слюнной железы гораздо больше, чем количество зараженных лимфоцитов в 1 куб.см. крови. Вот и получается, что в слюне их словить быстрее и надёжнее ( и гораздо проще по взятию материала), чем в крови. Там тоже будут вышедшие из клеток вирусы, но в очень маленьком количестве, гораздо меньше, чем в слюне. И мы их просто не улавливаем, в отличие от слюны.